外砂王厝人至此搭寮，圍地墾荒，捕魚為生。

清同治年間因避兵禍，外砂及洲畔咸塭村民遷此聚居而漸成村落。

原屬外砂鄉(xiāng)。

1934年屬壩頭鄉(xiāng)。

1949年屬上蓬區(qū)。

1951年稱南港鄉(xiāng)，屬海濱區(qū)。

1953年屬八區(qū)。

1958年9月成立澄海縣人民公社，屬第三支隊310團(tuán)。

1959年設(shè)南港生產(chǎn)大隊，屬壩頭人民公社。

1983年11月設(shè)區(qū)建鄉(xiāng)，設(shè)南港鄉(xiāng)，屬壩頭區(qū)。

1986年11月撤區(qū)置鎮(zhèn)，設(shè)南港村，屬壩頭鎮(zhèn)。

1990年9月設(shè)南港管理區(qū)。

1998年9月設(shè)南港村。

2002年1月壩頭鎮(zhèn)并入鳳翔街道，設(shè)南港社區(qū)，沿用至今。