轄地舊屬生仙里鄉，1935年為大瑯鄉、嶺霞鄉，1950年以大瑯鄉、怡善鄉之各一部分另置聯合鄉，拆嶺霞鄉為嶺霞、三源二鄉。

1956年2月，大瑯鄉復與聯合鄉之一部分合為大聯鄉，嶺霞、三源合并為嶺源鄉。

1958年建合村公社，1960年1月合村公社并入印渚公社，10月復置合村公社，1962年復屬合村公社，1962年11月，建制為合村、嶺源二公社。

1984年3月，合村、嶺源改公社為鄉。

2004年4月21日嶺源鄉并入合村鄉（浙政函〔2004〕63號）。

2004年12月18日，由原19個村委會調整為現6個村委會。