清代分屬寧海縣西鄉朱岙莊、石馬莊、婁坑莊。

1928年分屬珠溪、婁坑、石謝3鄉。

1940年三門建縣后改屬珠溪、石婁2鄉。

解放初沿用舊制。

解放初沿用舊制。

1950年7月分設珠岙、小港、馬婁3個鄉。

1956年2月小港、馬婁2個鄉合并，仍稱馬婁鄉。

1958年，改建珠岙、馬婁2個管理區。

1961年改稱珠岙、馬婁2個人民公社。

1983年政社分設，為珠岙、馬婁2個鄉。

1985年12月，珠岙鄉改制為珠岙鎮，轄23個村。

1992年5月撤銷馬婁鄉，并入珠岙鎮,全鎮轄43個村。

1994年，高枧鄉的馬山村劃歸朱岙鎮。

2004年，朱岙鎮的北山、前郭、梅村、南岙、下謝等6個村劃歸海游鎮。

2013年11月撤銷珠岙鎮、高枧鄉建制，組建新的珠岙鎮。

2018年行政村規模調整后，轄34個行政村。