古名新市，宋時設驛站名“新市驛”；清時屬瑞應鄉十四都；明洪武十四年(1381)，新市編為瑞應鄉十四都二圖。

民國17年(1928)，虹橋曾行村里制；19年改村里制為區、鄉鎮制，設鎮公所、區署，為區治所在。

1949年5月11日虹橋解放。

6月，建立虹橋鎮民主政府；9月底，改稱鎮人民政府；1956年，石帆鄉的鄔家橋村、西聯鄉的龍坦村、五權鄉的連橋村和東聯鄉的東洋村并入轄區；1958年成立虹橋管理區；1961年撤銷管理區，改為虹橋鎮公社；1980年經省人民政府批準為建制鎮，屬虹橋區。

1992年5月，東聯鄉、南陽鄉、瑤岙鄉并入，仍稱虹橋鎮；2011年5月，蒲岐鎮、南岳鎮建制撤銷，其行政區域并入虹橋鎮，調整后，虹橋鎮轄10個居民區、93個行政村，鎮政府駐地不變。

2015年12月，樂清市行政區劃部分調整，虹橋鎮劃出部分區域重設蒲岐鎮、南岳鎮。