2001年4月得名。

解放初屬鶴慶縣九頂區，1952年屬鶴慶縣第二區，1956年屬辛屯區，1958年人民公社化時劃歸城郊人民公社屬羅偉邑鄉，1959年為母屯管理區，1963年撤公社改區，管理區改為小公社為城郊區母屯小公社，1969年至1970年區又改為公社，小公社改為大隊為城郊公社母屯大隊，1980年初，調整部分生產大隊規模，從母屯大隊新分出彭屯大隊。

1984年撤社改區建小鄉為寶頂區母屯鄉，1988年，全縣開展區鄉體制改革，撤區建鄉為城郊鄉母屯村公所，2000年撤銷村公所改村民委員會，為母屯村民委員會，2001年4月撤鄉置鎮，撤銷城郊鄉設立草海鎮為草海鎮母屯村民委員會，名稱沿用至今。