1955年10月耿馬成立傣族佤族自治縣所下設的五個區58個編制中屬，58個鄉之一，隸屬耿馬宣區。

1969年是區、鄉、合作社改為公社，大隊、生產隊三級，耿宣區改為紅衛公社，石灰窯鄉改稱石灰窯大隊隸屬紅衛公社。

1984年2月至5月實行農村政設合一體制改革，社區建鄉政社分設，公社改區，大隊改鄉，生產隊改合作社。

原紅衛公社改稱為耿新區，石灰窯大隊改稱為石灰窯鄉隸屬耿宣區。

1988年1月至4月，實行區、鄉體制改革，區改鄉（鎮），鄉改村公所。

耿宣區與耿馬鎮合建立耿宣鎮后又更名為耿馬鎮，石灰窯鄉改稱為石灰窯辦事處，隸屬耿馬鎮。

2000年實行村集體制改革，村公所（辦事處改為村民委員會），石灰窯辦事處改稱為石灰窯村民委員會至今，隸屬耿馬鎮。