7世紀前，聶榮地方屬外象雄轄區。

后被蘇毗雅松占據，成為蘇毗部落聯盟成員。

8世紀中葉，蘇毗與吐蕃統一，聶榮一帶劃入“蘇毗茹”。

9世紀中葉，吐蕃陷入分裂割據，聶榮屬于“羌日六部”的“雄索部落”。

南宋寶慶三年（1227），青海蒙古汗的驕兵進入藏北，蒙古汗霍爾金格對藏北地區開始實施軍事統治，聶榮北為“霍爾三十九部族”的一部分。

元朝，聶榮縣境內只有阿扎買馬（阿美）、阿扎多馬（又稱阿斗）和扎瑪3個部落。

明末屬蒙古王東宮武藏統治，后為蒙古的和碩特部落管轄。

清康熙五十九年（1720），康熙帝派清軍驅逐準噶爾軍隊后，把聶榮等三十九族地方劃歸西藏地方政府管轄。

1916年，西藏政府開始管轄三十九族地區，設立霍而基巧（專署級）管理各部落。

1941年（藏歷木馬年），西藏地方政府撤銷霍爾基巧，將三十九族地區劃分為巴青、比如、阿扎白索、色扎、尺牘、丁青6個宗。

阿扎白索宗駐曲那格。

后因宗址偏僻，逐移到宗中心的色貢，稱為聶榮宗。

宗本由藏政府直接委派。

1950年10月，昌都解放后，三十九族地區也隨之解散，聶榮宗即歸昌都地區人民解放委員會管轄。

1951年7月，中共西藏工委三十九族分工委成立；11月初，即向各宗派出軍事代表，建立軍事代表處。

1956年10月，隨著形勢的發展，撤銷軍事代表處，建立聶榮宗黨委，歸昌都分工委丁青中心縣委領導。

1957年，由于昌都地方上層的叛亂分子加劇，根據中央決定，撤銷聶榮宗黨委。

1959年初，宗解委會結束工作。

1959年3月，西藏地方政府和上層反動集團發動全區性武裝叛亂，人民解放軍在西藏各界人民的支持下，經過一年多的斗爭，平息了這場反革命武裝叛亂，隨之，開展了轟轟烈烈的民主改革運動。

1959年5月，根據西藏工委關于《西藏地區行政區劃調整意見》，聶榮宗改為聶榮縣，劃歸那曲（黑河）專區。

1960年元月，國務院正式批準，同意撤銷聶榮宗，設置聶榮縣，隸屬黑河專區。

1970年，改屬那曲地區。

2017年7月，國務院下達《關于同意西藏自治區撤銷那曲地區設立地級那曲市的批復》（國函〔2017〕109號），同意撤銷那曲地區，設立地級那曲市。

聶榮縣屬那曲市管轄。