公元1世紀，悉補野部落第七代贊普止貢之子夏赤在工布建立小邦國，成為工噶布王（即工布王），統治包括米林在內的工布地區。

7世紀，吐蕃政權建立后，松贊干布把吐蕃地區的軍事組織為主的行政地區劃分成五大翼，即：衛茹、約茹、葉茹、茹拉、蘇毗茹，今米林縣屬于約茹管轄。

7世紀至9世紀，吐蕃政權時期，工布王劃地稱王，其轄區享有相對獨立性。

唐咸通十年（869年，藏歷土雞年），吐蕃發生奴隸平民起義。

起義首先從今米林縣與朗縣交界處爆發，起義軍推翻工噶布王的統治。

不久，吐蕃政權被推翻，西藏處于分散割據時期，工布地區未能形成統一的地方政權，每個地方由當地的貴族頭領統治。

11世紀，工噶布王后裔阿杰在工布恰納（米林境內羌納村）一帶崛起，成為工布地區統治者，米林亦屬于工布阿杰王的統轄區。

13世紀至14世紀中葉，元朝在西藏設烏思藏納里速古魯孫等三路宣慰使司都元帥府，米林縣境大部分屬其轄區。

14世紀50年代，帕木竹巴政權時期，明朝設烏思藏行都指揮使司，米林縣大部分屬其轄區。

明崇禎十五年（1642年，藏歷第十一饒迥水馬年），甘丹頗章政權派兵征服工布。

清康熙二年（1663年，藏歷第十一繞迥水兔年）新建則拉崗宗。

則拉崗宗轄16個“第巴”（“第巴”是民主改前西藏宗的基層行政機構，相當于鄉，既是官名又是行政區劃單位名稱）。

1921年（藏歷第十五饒迥鐵雞年），民國政府設川邊特別行政區，今米林縣屬川邊特別行政區管轄。

1939年（藏歷第十六饒迥鐵豬年），西康省正式建立，在江達設太昭局，米林縣納入其行政區劃，由于當時全國處于抗戰階段，西康省對金沙江以西的縣并沒有實行有效管轄。

1951年6月，波密分工委在昌都組建，7月，正式成立波密分工委。

則拉崗宗隸屬其管轄。

1954年，則拉崗宗屬塔工基巧。

1959年8月，將原則拉崗宗所轄的甲拉、大渡卡、結果、羌納、派多、庫加、臥龍、嘎加、江中、登米、勝布、康沙、扎西繞登13個地方合并，設置米林縣，屬塔工專區管轄。

1960年1月，經國務院批準，撤銷則拉崗宗（不含該宗東北部的嘎瑪、俄當2個地方），設置米林縣，隸屬林芝專區。

1960年2月，塔工專區公署更名為林芝專區公署，米林縣歸其管轄。

1964年7月，經國務院正式批準，林芝專區撤銷，米林縣劃歸拉薩市管轄。

1983年10月，經國務院批準，恢復林芝地區行政公署，米林縣歸林芝地區管轄。

1986年2月，米林縣正式復歸林芝地區管轄。

2015年3月，國務院批準撤銷林芝地區，設立地級林芝市，米林縣屬林芝市管轄。