漢代為莎車國地。

唐屬磧南州。

清屬葉爾羌。

清平定大小和卓后，在澤普建軍臺，設坡斯坎木臺，置六品喀孜伯克署事，轄于葉爾羌辦事大臣。

光緒九年(1883)，劃歸葉城縣管轄。

二十八年（1902），莎車直隸州升為府，直屬府治。

二十九年（1903），上下波斯坎重劃歸葉城縣統屬，設稽查員置理莊務。

1920年，波斯坎隨葉城縣劃歸和闐道。

1921年，又劃歸喀什噶爾道管轄。

同年11月10日，正式建縣，屬喀什噶爾道。

1942年，增設莎車行政區(次年改為莎車督察專區)，澤普縣改隸莎車督察專區。

1949年，屬莎車專區。

1956年6月，莎車專區撤銷，劃歸喀什地區。