喀什全稱“喀什噶爾”，有文字記載的歷史2000多年。

前60年，漢朝在烏壘（今輪臺縣東野云溝南）設置西域都護府后，喀什作為西域一部分，正式納入中國版圖。

南北朝至隋代，今喀什地區境內主要有疏勒、朱俱波、渴盤陀等國，多次遣使至中原朝貢。

唐顯慶三年（658年），唐朝在平定西突厥阿史那賀魯之亂后，在疏勒設置都督府，府下設15個州，范圍囊括今喀什地區全境及克孜勒蘇柯爾克孜自治州，地域遼闊，為當時有名的“安西四鎮”之一。

它曾有力地維護了西域與內地在政治上的統一，保障了盛唐時期“絲綢之路”的暢通。

喀喇汗王朝建立后，這里為其東部重鎮和陪都，“喀什噶爾”一名從此顯見于史籍。

慶歷元年（1041年）前后，喀喇汗王朝分裂為東、西兩部，東喀喇汗王朝建都于喀什噶爾，今地區轄境屬汗國近畿之地。

1218年后，今喀什地區境內成為蒙古汗國的轄地。

淳口十二年（1252年），蒙古設立別失八里等處行尚書省，喀什噶爾等城受其管轄。

1514年，葉爾羌汗國建立，今喀什地區為其核心區域和政治、經濟、文化中心。

乾隆二十四年（1758年），清朝在平定大小和卓之亂后，在喀什噶爾設“總理回疆事務參贊大臣”，管理南疆八城（喀什噶爾、英吉沙爾、葉爾羌、和闐、阿克蘇、烏什、庫車、喀喇沙爾）事務。

光緒九年（1883年）設置喀什噶爾道。

1929年改喀什道為喀什行政區。

1943年設喀什督察專區。

1949年設喀什專區。

1954年成立南疆行政區。

1956年恢復喀什專區。

1970年改稱喀什地區，沿用至今。