1922年，花果園村隸屬襄垣縣第三區(qū)第十三編村（主村北南坪）所轄。

清宣統(tǒng)元年（1909），花果園村隸屬襄垣縣北南坪保所轄。

1937年，花果園村隸屬襄垣縣第三區(qū)北南坪編村所轄。

1953年6月，花果園村隸屬襄垣縣第五區(qū)南坪鄉(xiāng)所轄。

1956年，花果園村隸屬襄垣縣南煙（巖）鄉(xiāng)所轄。

1958年9月，該村隸屬襄垣縣下良人民公社所轄，稱花果園村管理區(qū)。

1959年9月，該村隸屬襄垣縣西營人民公社所轄，稱花果園生產大隊。

1984年4月，該村隸屬襄垣縣西營鎮(zhèn)所轄，稱花果園村村民委員會至今。