地境原南部屬上海縣，北部屬寶山縣。

光緒二十五年（1899），吳淞江以南今膠州路以東地域被擴占為公共租界。

1927年，南北兩部地境分屬法華、閘北、彭浦、真如、蒲淞等區。

1943年8月，日偽政權在全市設立30個警區，區境內建立第十三警區。

1945年抗日戰爭勝利，12月15日將全市按警區設置行政區，設立第十三區，又名普陀區。

1947年1月，取消序數區名，稱普陀區。

解放后行政境域歷經多次調整，至2009年1月起成今狀。

地名沿用至今。