明清時期南部除前后田平屬崇文鄉外，其余均屬清淵鄉；北部除萬善鄉前街為邱縣飛地外，其余均為館陶縣地。

1937年前，南部屬冠縣第七區，萬善前街仍屬邱縣飛地，其余為館陶第一、七區。

建國初，西12村分屬館陶縣第一、七區，其余為冠縣第七區。

1958年，分屬館陶縣北館陶區、冠縣城關區。

1965年，館陶縣漳衛河東岸的北館陶區劃入冠縣后，分屬北館陶區、城關區。

1971年，撤區并社，由萬善、王段2個小公社，合并成立萬善公社。

1984年撤公社改鄉，稱萬善鄉至今。