古屬羌地。

西晉末為吐谷渾屬地。

隋大業五年(609)，屬赤水縣，隸河源郡。

唐龍朔三年(663)，入吐蕃。

宋初為吐蕃地方政權唃廝啰轄地。

元代屬吐蕃等處宣慰司。

明洪武六年(1373)，屬朵甘衛積石州千戶和歸德守御千戶所轄。

洪武七年，屬朵甘行都指揮使司積石州千戶和歸德守御千戶所。

崇禎十年(1637)，為衛拉特蒙古和碩特部顧實汗轄區。

清雍正三年(1725)，今縣西南部為和碩特南右中旗駐牧地，東北部主要為藏族部落駐牧地。

雍正四年，后藏族駐牧區由河州同知管轄。

乾隆二十七年(1762)，今縣東北部為循化廳地，隸蘭州府。

五十六年(1791)，改隸于欽差辦理青海蒙古番子事務大臣和循化廳。

1913年，屬西寧道循化縣。

1929年，屬青海省同仁縣地。

1940年，今同仁、澤庫兩縣的大部分地區，隸屬青海省第七督察專員公署。

1953年，由同仁縣析置澤庫縣，治溑乃亥，屬黃南藏族自治區。

1955年，屬黃南藏族自治州。