黑河鄉位于縣境中南部，縣府駐地（鄉府駐地距縣府15千米）。人口0.3萬（包括縣屬城鎮居民），以藏族為主，占總人口的69.7％，還有漢、回、撒拉等民族。面積4924平方千米。轄江多、隆埂、坎木青、尕拉、赫拉、江措6個牧委會。原屬達日縣和科區，1958年隸黃河沿公社，1963年分設黑河公社，1984年改設黑河鄉。

2006年8月，瑪多縣撤銷黑河鄉，設立瑪查里鎮（鎮政府遷駐瑪查里）。

花石峽鄉位于縣境東北部，距縣府駐地67千米。人口0.1萬，以藏族為主，占總人口的97.3％。面積3188平方千米。轄措柔、卓蘭、東澤、造日埂、日謝、日榜6個牧委會。1957年隸甘德縣花石峽區，同年劃歸瑪多縣，1958年改設花石峽公社，1984年改設花石峽鄉。地處山原、河谷地，東鄰措那湖南岸。

　　黑海鄉位于縣境東北部，距縣府駐地67千米。人口0.1萬，以藏族為主，占總人口的97.3％。面積3429平方千米。轄吉日邁、加木恩、豆措、那爾扎、維日埂5個牧委會。1958年隸花石峽公社，1963年分設黑海公社，1984年改設黑海鄉。

　　清水鄉位于縣境東北部，距縣府駐地67千米。人口0.1萬，以藏族為主，占總人口的97.8％。面積2187平方千米。轄扎地、折合邁、斗地、斗納、加果5個牧委會。1958年屬花石峽公社，1963年分設清水公社，1984年改設清水鄉。2001年3月5日青海省人民政府青政函[2001]14號文批復：撤銷清水、花石峽、黑海3鄉，合并設立花石峽鎮（鎮政府駐地設在原花石峽鄉）。

因黃河流經鄉境內而得名。1958年，屬黃河沿公社。

1963年，黃河沿公社析置黃河公社。

1984年，黃河公社改設黃河鄉。

黃河鄉位于縣境中部，距縣府駐地60千米。人口0.2萬，以藏族為主，占總人的口的99.6％。面積5610平方千米。轄江旁、熱曲、阿映、白瑪納、唐格瑪、哲合瑪6個牧委會。原屬達日縣和科區，1958年屬黃河沿公社，1963年分設黃河公社，1984年改設黃河鄉。

扎陵湖鄉因境內淡水湖扎陵湖而得名。1957年12月前，扎陵湖鄉轄區由果洛族自治州甘德縣、達日縣管轄。

1957年6月，設立瑪多縣，扎陵湖鄉一帶屬瑪多縣和科區管轄。

1958年11月，隸屬黃河公社管轄。

1959年6月25日，瑪多縣劃歸海南族自治州后設2區9社，轄區由黃河沿區管轄。

1962年3月，設扎陵湖公社；同年11月，復歸果洛藏族自治州。

1984年6月，扎陵湖公社改稱扎陵湖鄉。

扎陵湖鄉位于縣境西北部，距縣府駐地32千米。人口0.2萬，以藏族為主，占總人口的97.6％。面積6137平方千米。轄尕澤、多涌、擦澤、鄂陵、勤那、阿涌6個牧委會。原屬達日縣和科區，1958年隸轄黃河沿公社，1963年分設扎陵湖公社，1984年改設扎陵湖鄉。境內有馳名的扎陵湖、鄂陵湖。