1949年前名贛縣直屬區水西鄉第11保；1949年后名贛縣水西區水西鄉善邊村；1950年屬湖邊區梨園鄉；1958年9月屬紅旗公社湖邊管理區梨園工區；1959年10月名善邊大隊，屬湖邊公社；1961年4月從贛縣劃屬贛州市，名八0三公社善邊大隊；同年11月復歸贛縣，名湖邊區湖邊公社善邊大隊；1965年撤區，屬湖邊公社；1968年11月與劉家坊大隊并入崗邊大隊；1972年10月分出，復名湖邊公社善邊大隊；1978年元月隨公社再從贛縣劃屬贛州市；1984年4月公社改鄉后，名湖邊鄉善邊村。

1999年，撤地建市后，劃歸章貢區湖邊鄉。

2009年3月17日成立贛州市經開區后，委托經開區管理至今。