明代屬瑞昌縣金城鄉。

清名金一、金二鄉。

1912年屬下北鄉，后改為區。

1938年秋，日軍侵占碼頭，更名為泥灣鎮。

1945年后，泥灣鎮改名碼頭鎮，駐地碼頭街。

1950年元月，屬瑞昌縣碼頭區，下設9個小鄉。

1957年，合并為碼頭、黃嶺、武蛟3個鄉。

1958年9月，成立碼頭人民公社，范圍包括碼頭和黃嶺。

1972年，黃嶺劃出，仍名碼頭公社。

1984年3月，公社改為鎮。

2007年11月，原流莊鄉整體并入碼頭鎮。