雙鐘鎮(zhèn)遠在唐、虞、夏、商時代，屬揚州南境。

漢在此設鄡陽鎮(zhèn)。

三國及晉，隸彭澤縣。

南朝劉宋置湖口戌。

南唐昇元二年（938）置湖口縣，治鄡陽鎮(zhèn)，自此歷為縣治。

清朝，在此設鎮(zhèn)，因境內(nèi)有上石鐘山和下石鐘山命名為雙鐘鎮(zhèn)，地名源此并沿用至今。

1949年前，為雙鐘鎮(zhèn)。

1949年，仍稱雙鐘鎮(zhèn)，屬城關區(qū)轄。

1950年置雙鐘鎮(zhèn)，1958年改雙鐘鎮(zhèn)人民公社。

1980年，復稱雙鐘鎮(zhèn)，沿用至今。

2001年底，撤銷三里鄉(xiāng)，劃歸雙鐘鎮(zhèn)。