1940年10月，屬阜寧縣抗日民主政權第一區。

1941年10月，改屬第二區。

1942年，夏屬吉溝區。

1943年初，復屬第二區。

1944年末，建立新溝區。

1946年7月，改屬第三區，年底改屬新第二區。

1947年8月，為新溝區。

1956年2月，并入陳集區。

1957年8月，設立新溝鄉。

1958年9月，與陳集鄉合并成立陳集先進公社，后改名新溝先進公社。

1959年4月，析出陳集公社。

1983年，復置新溝鄉。

1995年6月，撤銷新溝鄉設立新溝鎮。