1948年1月屬第六區（呂堰驛）；1948年8月屬第五區（姜溝）；1951年屬古驛區轄；1953年屬第八區；1954年屬古驛區；1955年建立東吳初級農業生產合作社，1956年建立東吳高級農業生產合作社；1958年人民公社化后，更名為東吳大隊，屬羅崗鄉（宇宙人民公社）；1959年屬黃集人民公社；1965年屬古驛區；1968年稱東吳大隊革命委員會，屬古驛區；1975年屬古驛人民公社；1980年復稱東吳大隊，屬古驛公社；1984年改稱東吳村村民委員會，屬古驛區下涂鄉轄；1987年9月撤區設鄉鎮屬黃渠河鄉轄；1995年12月撤鄉設鎮屬黃渠河鎮轄；2001年3月行政區劃調整，撤銷黃渠河鎮合并到古驛鎮，東吳村屬古驛鎮轄至今。