明、清屬咸寧縣金城鄉十二都。

民國時期先后隸屬咸寧縣第一區（駐馬橋）柏墩鄉、第二區（駐柏墩）柏墩聯保、柏墩鄉、和順鄉、和樂鄉。

1949年5月，下街（又名老街）、祝家、張家、木梓坳陳家、木梓坳李家、山下顧6個村莊，水口、中田畈、畈背、港背何、背頭何（又名堰頭何）5個村莊，隸屬咸寧縣和樂鄉（駐柏墩老街與山下顧之間畈上）柏墩保（駐何家祠堂）。

同年6月，下街等6個村莊、水口等5個村莊所在的柏墩保，隸屬咸寧縣馬橋區（駐馬橋老街中段福壽圖）。

1950年，改保、甲制為村、閭制。

下街等6個村莊、水口等5個村莊所在的柏墩保改稱柏墩村，木梓坳陳家、木梓坳李家劃入石城村（駐大屋雷）。

1951年，下街、祝家、張家、山下顧4個村莊，水口等5個村莊，隸屬馬橋區改稱的五區（駐馬橋老街中段福壽圖）柏墩鄉（小鄉，駐何家祠堂）。

木梓坳陳家、木梓坳李家隸屬五區石城村改稱石城鄉（小鄉，駐大屋雷）。

同年5月，成立農業生產互助組。

同年11月，柏墩鄉（小鄉）、石城鄉（小鄉）隸屬增設的六區（駐柏墩老街與山下顧之間畈上）。

1954年3月，柏墩鄉（小鄉）、石城鄉（小鄉）隸屬六區與五區合并的五區（駐馬橋老街中段福壽圖）。

同年，柏墩、祝家、張家、山下顧、木梓坳陳家、木梓坳李家6個村莊和水口、中田畈、畈背、港背何、背頭何5個村莊，組成中田一初級社（駐何家祠堂）。

1956年1月，初級社升格為高級社。

中田一初級社分為柏墩、花園2個高級社。

柏墩高級社駐柏墩老街與山下顧之間畈上，轄下街、祝家、張家、木梓坳陳家、木梓坳李家、山下顧6個村莊。

花園高級社駐何家祠堂，轄水口、中田畈、畈背、港背何、背頭何5個村莊。

柏墩、花園2個高級社隸屬柏墩鄉（大鄉，駐柏墩老街與山下顧之間的畈上）。

成立柏墩鎮，駐柏墩老街，轄柏墩老街。

同年6月，柏墩、花園2個高級社隸屬柏墩農村生產指導組（駐柏墩老街）柏墩管理區。

1957年2月，柏墩、花園2個高級社隸屬雙城、柏墩2個管理區合并的柏墩管理區（駐柏墩老街）。

同年9月，柏墩、花園2個高級社隸屬二區（駐馬橋老街中段福壽圖）柏墩鄉。

1958年9月，柏墩高級社改稱柏墩大隊，花園高級社改稱花園大隊。

2個大隊隸屬柏墩公社（區級）柏墩管理區（駐柏墩街老街后湖北省國營茶場1中隊）。

同年10月，柏墩、花園2個大隊隸屬柏墩公社與五星公社（駐馬橋新街胡家新屋）合并的馬橋公社（駐馬橋新街胡家新屋）下轄的柏墩管理區。

1961年4月，柏墩、花園2個大隊隸屬馬橋區柏墩公社。

1963年3月，柏墩公社分為柏墩、雙城（駐蘇家坊）2個公社。

柏墩、花園2個大隊隸屬從柏墩公社分出的柏墩公社。

同年11月，柏墩、花園2個大隊隸屬雙城、柏墩2個公社合并的柏墩公社（駐柏墩街）。

1975年3月，撤區并社。

柏墩、花園2個大隊隸屬桂花公社（駐柏墩街睏龍山北坡山腳下）。

柏墩老街由柏墩大隊管轄。

1984年1月，撤銷公社，恢復區、鄉。

柏墩、花園2個大隊隸屬馬橋區桂花鄉（駐柏墩街睏龍山北坡山腳下）。

成立柏墩鎮，駐柏墩街，轄柏墩街。

同年7月，柏墩、花園2個大隊隸屬桂花鄉與柏墩鎮合并的桂花鎮（駐睏龍山北坡山腳下）。

1985年9月，生產大隊、生產隊改稱村、組。

柏墩大隊改稱柏墩村，花園大隊改稱花園村。

1987年9月，柏墩、花園2個村隸屬撤銷區建制的桂花鎮。

2001年3月，柏墩、花園2個村隸屬南川鄉與桂花鎮合并的桂花鎮。

2005年3月，柏墩、花園2個村合并為柏墩村，先駐五老山下柏墩小學北側，2007年12月駐柏墩街何功偉路南側。