明清朝時期屬蘄水縣義門南鄉；民國時期屬第三區；1955年由子勤、蘭輝等5個初級社合并成立十三廟高級社，屬團陂區；1958年人民公社化時成立十三廟大隊，屬團陂公社；1974年撤區并社與開光大隊合并為十三大隊，屬華桂公社；1980年11月與開光大隊分開，定名十三廟大隊；1981年以駐地十三廟定名為十三廟大隊；1984年恢復區、鄉、村建制屬團陂區十三廟鄉，原十三廟大隊更名為十三廟村民委員會；1988年撤區建鄉屬華桂鄉；2001年合并鄉鎮屬團陂鎮。