民國初年屬由義區(qū)新店村。

民國二十五年屬4區(qū)峪南鄉(xiāng)。

民國三十三年屬新店鄉(xiāng)。

建國前夕屬石花區(qū)。

1949年隸屬第二區(qū)（石花區(qū)）管轄。

1951年6月，屬石花區(qū)水星鄉(xiāng)。

1956年成立高級社時，取名星星社，屬縣轄新店鄉(xiāng)。

1958年人民公社化時期更名為星星大隊，屬幸福之家（石花）人民公社新店管理區(qū)。

1961年恢復(fù)區(qū)制，屬石花區(qū)新店公社。

1975年撤區(qū)并社，屬石花公社新店管理區(qū)。

1981年更名為水星臺大隊，屬大峪橋公社新店管理區(qū)。

1984年更名為水星臺村，屬大峪橋鎮(zhèn)新店鄉(xiāng)。

1995年，屬大峪橋鎮(zhèn)。

2001年大峪橋鎮(zhèn)被撤銷，其所轄行政管理區(qū)劃歸石花鎮(zhèn)，水星臺村由石花鎮(zhèn)管轄至今。