明朝嘉靖年間屬惠化鄉；清朝康熙年間屬從義鄉；民國時期屬平林鄉；1949年5月屬馬坪區；1956年為先鋒二社，屬馬坪區長嶺鄉；1958年成立人民公社時，為先鋒二大隊，屬長青公社長嶺管理區；1959年為先鋒二大隊，屬馬坪公社長嶺管理區；1961年4月恢復區（鎮）建制，為先鋒二大隊，屬長嶺區長嶺公社；1975年2月撤區并社，為先鋒二大隊，屬長嶺公社；1980年更名為五同寺大隊，屬長嶺公社長嶺管理區；1983年底設區建鄉，為五同寺村，屬長嶺區長嶺鎮；1987年9月撤區并鄉，為五同寺村，屬長嶺鎮；1998年統一換發村民委員會印章時，將公章刻為梧桐寺村后，就正式更名為梧桐寺村，屬長嶺鎮至今。