清光緒七年(1881)屬高枧團白濟聯保,稱磨石保;民國二十三年(1934年)屬五區山城鄉管轄;民國二十四年(1935年)屬五區土城聯保管轄;民國三十五年(1946年)屬樹亭鄉管轄,為磨石保;1952年歸五區管轄。
稱磨石鄉;1956年,歸兩河區白濟鄉管轄;1958年人民公社化運動,改稱磨石溝生產大隊,歸通省公社、白濟管理區管轄;1975年撤區并社,磨石村劃歸為土城公社,稱磨石大隊;1984年設區建鄉,劃歸紅塔區高枧鄉管轄,成立磨石村村民委員會;1987年撤區建大鄉,劃為紅塔鄉管轄,隸屬高枧管理區;2002年歸紅塔鄉管轄;2012年鄉改鎮,屬紅塔鎮管轄。