西周屬衛。

春秋置蒲邑（今長垣縣城）、匡邑（今惱里）。

戰國屬魏，并匡、蒲置首垣邑（遺址在今滿村鎮陳墻一帶）。

秦始皇二十六年（前221）改首垣邑為長垣縣，屬三川郡。

西漢天漢三年（前98）至初始元年（8），境內置有長羅侯國（今樊相一帶）。

新莽始建國元年（9）至地皇四年（23）更長垣縣名為長固縣，屬兗州陳留郡。

更始元年（23）復名長垣縣。

東漢建武元年（25）析置長垣侯國。

三國屬魏。

西晉泰始元年（265）屬陳留國。

隋開皇十六年（596）移縣治于婦姑城（今南蒲街道司坡一帶），以治南有古匡城改名匡城縣，屬東郡。

五代后梁開平元年（907）為避太祖朱溫父名諱，復長垣縣，屬汴州。

后唐同興元年（924）仍名匡城縣。

宋建隆元年（960）避太祖匡字諱，改為鶴丘縣，屬京畿路開封府。

大中祥符元年（1008）廢鶴丘，仍名長垣。

金泰和四年（1204）縣治遷鮑堌村（今苗寨鎮舊城一帶），改屬大名路開州。

元太祖二十二年（1228）改縣名為保垣州，地域東擴。

數年后，仍名長垣縣，東擴地域歸縣。

明洪武二年（1369）避水患，縣治移古蒲城，即今址。

清天命元年（1616）屬直隸省大名府。

1912年屬直隸省大名道。

1936年屬河北省第十一行政督察區。

1949年屬平原省濮陽專區。

1952年歸河南省濮陽專區。

1954年改屬新鄉專區。

1955年屬安陽專區。

1958年改屬新鄉專區。

1961年復屬安陽專區。

1969年屬安陽地區。

1983年屬濮陽市。

1986年屬新鄉市。

2019年撤銷長垣縣，設立長垣市（縣級）。