清乾隆元年（1736），設立烏蘭諾爾站（今肇源縣新站）至呼蘭城驛路，在額設6臺中依次排為第一臺，故名“頭臺”。

中華民國時期，郭爾羅斯后旗設頭臺鄉。

東北淪陷后，初設頭臺保，后改設頭臺村。

1945年“九三”抗日戰爭勝利后，1946年設置頭臺區，1949年改為第五區。

1956年3月，設置頭臺鄉。

同年4月，改隸肇源縣。

1958年9月，改稱頭臺人民公社。

1984年3月，改為頭臺鄉。

1985年5月，改設頭臺鎮。