巖門村，明清時期屬清潭里九甲。

民國二年（1913年），屬南二下區官田保。

民國二十一年，屬南七下區官田鄉。

民國三十年（1941年）屬團溪鄉新民鄉。

1949年11月21日，屬團溪區新民鄉。

1950年6月，屬十三區新民鄉。

1953年5月，屬十三區新民鄉。

1955年9月，屬尚稽區新民鄉。

1958年10月，屬尚嵇基層人民公社新民公社新民大隊。

1961年8月，屬尚嵇人民公社新民公社。

1984年5月，屬新民鄉新民村。

1992年9月，屬新民鎮新民片區。

2003年12月，由原巖門村、六坪村合并組建為巖門村。