清順治十五年（1658年），為修文縣仁和里轄地。

民國二十年（1931年）秋，保改鄉鎮，屬息烽縣三區轄地。

民國三十年（1941年），息烽縣降為三等縣，鹿窩鄉屬西山鄉。

1951年2月，劃歸九莊鎮。

1992年前，屬息烽縣九莊區。

1992年，撒區并鄉，原新楊鄉撒銷，所屬的楊寨，甕舍，新民3村全部劃歸鹿窩鄉，黑神廟區的王家坪鄉也被撒銷，所屬的西安、合箭2村井入鹿窩鄉。

2016年4月22日，撤銷鹿窩鄉，設置鹿窩鎮。