1915年，屬西南區和西區。

1931年，屬四區。

1937年屬慶德鄉。

1949年屬第一軍事督導區之慶德鄉。

1950年屬4區之慶德鄉。

1953年，屬5區。

1956年，屬文家店區。

1958年公社時代，取名棟青坳大隊，屬文家店公社管轄。

1961年，撤銷以區為公社的建制，將管理區改為公社。

1981年，棟青坳大隊屬合朋溪區瓦窯公社管轄。

1984年撤大隊設棟青坳村，屬合朋溪區的瓦窯鄉管轄。

1992年2月，貴州省人民政府批準思南縣進行“建鎮并鄉撤區”工作，同年10月，撤銷香壩鄉、流水苗族土家族鄉、碗水鄉、瓦窯鄉、場坪鄉合并建立香壩土家族苗族鄉，轄原五個鄉鎮的共26個行政村，棟青坳村屬香壩土家族苗族鄉管轄。

2007年4月，縣人民政府下達《關于撤小村并大村整合的批復》，全縣開展撤小村并大村工作，把全縣561個村合并成168個村，香壩土家族苗族鄉將原26個村合并為7個村，其中，瓦窯村由棟靑坳村、凡家灣村、瓦窯村合并而成。

2010年11月16日，思南縣人民政府批準調整全縣行政區劃，同意思唐鎮等27個鄉鎮行政村（社區）調整設置為行政村489個，社區37個。

香壩土家族苗族鄉調整設置為23個行政村，2個社區，棟青坳村屬香壩土家族苗族鄉管轄。