1921年屬鶴齡鄉。

1927年屬思南縣合朋復興區署。

1952年屬長壩鄉。

1953年建初級社，1957年建高級社，1958年公社時代，取名萬古大隊，屬長壩公社管轄。

1961年，撤銷以區為公社的建制，將管理區改為公社。

1963年，謝萬古大隊屬水塘公社管轄。

1972年，公社區劃調整，塘頭區撤銷坡頂公社并入長壩、合朋兩個公社，撤銷水塘公社，并入長壩公社，萬古大隊屬長壩公社管轄。

1982年，恢復坡頂、水塘公社，萬古大隊屬水塘公社管轄。

1984年撤隊設萬古村屬合朋溪區的水塘鄉管轄。

1992年2月，貴州省人民政府批準思南縣進行“建鎮并鄉撤區”工作，同年10月，撤銷長壩鄉、坡頂苗族土家族鄉、水塘鄉合并建立長壩苗族土家族鄉，轄原三個鄉鎮的共15個行政村，萬古村屬長壩苗族土家族鄉管轄。

2007年4月，縣人民政府下達《關于撤小村并大村整合的批復》，全縣開展撤小村并大村工作，把全縣561個村合并成168個村，長壩苗族土家族鄉將原15個村合并為4個村，其中，尖山村由長青村、太平村、尖山村、萬古村合并而得。

2010年11月16日，思南縣人民政府批準調整全縣行政區劃，同意思唐鎮等27個鄉鎮行政村（社區）調整設置為行政村489個，社區37個。

長壩苗族土家族鄉調整設置為14個行政村，1個社區，萬古屬長壩苗族土家族鄉管轄。