秦置漢陽縣，西漢屬犍為郡，東漢屬犍為屬國，為都尉治所。
三國屬為南昌縣地。
晉改為南秦縣。
唐為羈縻綠洲、寶洲地。
宋屬烏撒部。
元為烏撒路。
明屬烏撒府、烏撒衛(wèi)。
清康熙四年(1666年)置威寧州入隸，縣城稱墨特川，雍正四年(1726年)改墨特川為墨章，后改為赫章，1942年析威寧縣赫章、可樂、野馬川、財神塘4區(qū)置縣，以駐地赫章命名，屬第四行政督察區(qū)。
1949年屬畢節(jié)專區(qū)。
1970年屬畢節(jié)地區(qū)。
2011年屬畢節(jié)市。
近年來，依托當?shù)氐乩怼夂虻茸匀粌?yōu)勢條件，赫章縣大力發(fā)展花卉產(chǎn)業(yè)，有效鞏固拓展脫貧成果，助推鄉(xiāng)村振興。