雁山區(qū)區(qū)境，春秋戰(zhàn)國時期屬楚國，秦漢時屬桂林郡，西漢至隋代屬始安縣，唐宋元明清各代均屬臨桂縣地。

1913年，屬桂林縣地。

1939年，屬桂林市和臨桂縣地。

1950年4月區(qū)境分屬臨桂縣大圩區(qū)、龍門區(qū)、柘木區(qū)、良豐區(qū)，同年10月分屬臨桂縣第一區(qū)（大圩）、第二區(qū)（柘木）、第九區(qū)（良豐）、第十區(qū)（六塘）。

1956年6月分屬桂林市近郊區(qū)，臨桂縣大圩區(qū)、雁山區(qū)。

1957年11月分屬桂林市近郊區(qū)奇峰鄉(xiāng)，臨桂縣雁山鄉(xiāng)、大埠鄉(xiāng)、大圩鄉(xiāng)。

1958年9月分屬桂林市近郊區(qū)秀峰人民公社、臨桂雁山人民公社、大圩人民公社。

1960年7月，桂林市近郊區(qū)撤銷，區(qū)境分屬桂林市城區(qū)陽橋人民公社、國營良豐農(nóng)場、臨桂縣大圩人民公社。

1981年5月7日靈川縣大圩公社潛經(jīng)大隊、草坪大隊劃歸桂林市。

同年7月成立近郊區(qū)草坪人民公社。

1984年5月恢復郊區(qū)建制。

1984年7-9月公社改為鄉(xiāng)鎮(zhèn)，9月29日成立草坪回族鄉(xiāng)，區(qū)境分屬為桂林市郊區(qū)雁山鎮(zhèn)、柘木鎮(zhèn)、大埠鄉(xiāng)、草坪回族鄉(xiāng)。

1996年12月根據(jù)《國務院關(guān)于同意廣西壯族自治區(qū)調(diào)整桂林市轄區(qū)行政區(qū)劃的批復》國函﹝1996﹞110號，設立雁山區(qū)，沿用至今。