東晉大興元年（318）分鬰林郡設晉興郡，置郡治晉興縣（今南寧），為南寧建制之始。

南朝梁，屬桂州。

隋開皇十四年（594）廢晉興郡，留晉興縣，屬尹州；開皇十八年（598）晉興縣改稱宣化縣；大業二年（606）改屬鬰州，大業三年（607）屬鬰林郡（治今貴港市）。

唐武德四年（621）置南晉州，治宣化縣，屬嶺南道；貞觀六年（632），因州城西南臨邕溪水，唐太宗改南晉州為邕州，“邕城”別稱及“邕”簡稱源于此；天寶元年（742）改為朗寧郡，乾元元年（758）復名邕州；咸通三年（862）分嶺南為東西兩道，嶺南西道治邕州，為省級政權駐地之始。

后嶺南西道改為建武軍。

五代天福七年（942）因避朝諱改稱誠州，屬楚。

后周廣順元年（951）復名邕州，屬南漢，仍為建武軍節度使駐地。

宋開寶五年（972）晉興縣改稱樂昌縣，邕州屬廣南西路，景祐二年（1035），樂昌縣廢省入武緣縣。

元至元十三年（1276）改置邕州安撫司，屬廣南西道宣撫司；至元十六年（1279）改邕州安撫司為邕州路；泰定元年（1324）因南疆兵亂平定，元朝庭取南疆安寧義改邕州路為南寧路，屬湖廣行中書省，為現名之始。

明洪武元年（1368）廢路置府，南寧府治宣化縣，屬廣西布政使司。

清屬廣西行省。

1912年廢宣化縣，南寧府直屬廣西軍政府，同年軍政府改稱省政府，南寧為省會；1913年6月廢府置邕南道，治南寧縣，屬廣西省；1914年6月避云南省南寧縣（今曲靖市）同名改稱邕寧縣，邕南道改稱南寧道；1927年廢南寧道，直屬廣西��；1929年7月設南寧市政府，與邕寧縣合署，同年11月撤銷市政府；1930年置邕寧民團區，駐邕寧縣，屬廣西�。�1932年4月，邕寧、賓陽2個民團區合并置南寧民團區，治武鳴，屬廣西��；1934年改置南寧行政監督區；1936年廣西省會遷至桂林；1939年南寧行政監督區治所改駐南寧；1940年南寧行政監督區改為第九行政督察區，屬廣西��；1942年和第八區合并為第四行政督察區，治南寧；1949年12月4日南寧解放；1950年2月建置南寧市，為廣西省會；1952年12月廣西省設桂西僮族自治區，為區政府駐地；1956年為桂西僮族自治州政府駐地；1958年3月5日廣西僮族自治區成立，為首府；1959年南寧市改由南寧專區代管；1961年12月復為廣西僮族自治區直轄；1965年屬廣西壯族自治區至今。