清乾隆年間（1736-1795年），鄭、葉、楊、朱四姓先祖分別從睦洲鄉、三江馬駟遷此耕種，隨后翁、林、周、李等姓從三江良德沖、羅灣、西安到此定居。

民國期間（1912-1932年）梁姓也到此定居，逐漸發展成4個居民點。

腰股村等民國期間屬第八區睦洲鄉。

1951年腰股、蓮子塘、東南環合為第九區蓮腰鄉。

1958年屬蓮腰管理區。

1959年分稱腰股大隊、東南灣大隊。

1961年東南灣分出新前大隊和南環大隊，分稱腰股大隊、南環大隊。

1965年屬蓮腰大隊。

1982年分出稱腰股大隊、東南大隊。

1984年屬蓮腰鄉。

1986年分稱腰股村委會、東南環村委會。

1988年分稱腰股管理區、東南環管理區。

1999年分稱腰股村委會、東南環村委會。

2004年合并稱蓮腰村委會，沿用至今。