新中國成立前，萬山原屬中山縣轄。

1951年1月，屬廣東省人民政府海島管理局珠江分區，后改為珠江專區海島管理處，隸屬珠江專署。

1952年7月，海島管理處移交給中山縣。

1952年12月，屬中山縣漁民區轄。

1953年5月1日，屬珠海縣第一區（唐家）管轄。

1958年底，成立公社。

并人中山縣．當時包括桂山島、。

擔桿列島、外伶仃及佳蓮列島。

1961年，屬珠海縣轄。

1963年，劃出擔桿、廟灣、外伶仃海島成立擔桿公社。

1974年，又劃出桂山等島嶼成立桂山公社。

1979年，屬市轄。

1984年，屬香洲區轄。

1986年，撤區改鎮。