元代前，稱石窟。

元代改稱懷仁里。

明崇禎六年（1633年）建縣署時，即動工創筑鎮平縣城池，為縣署所在地。

民國十年（1921年）設蕉陽鎮，成立鎮公所。

民國二十二年（1933年），劃入蕉嶺縣第一區。

中華人民共和國成立初期，仍稱蕉陽鎮，劃為蕉嶺縣第二區。

1952年8月，改稱蕉嶺鎮，由縣直轄。

1961年3月，設城鎮管理區，屬城鎮人民公社。

1964年，仍稱蕉城鎮。

1971年，更名為城鎮人民公社。

1981年4月，恢復蕉城鎮。