西漢，屬高涼縣。

東漢至陳，屬高興縣。

隋開皇九年（589年）后，屬石龍縣。

明、清，設申一二都、申一三都，屬化州縉紳鄉。

民國十七年（1928年），設南安中、南安東、南安南、南安西、南安北、旺嶺等鄉，屬化縣第二區。

民國三十一年（1942年），設南安、南岐2鄉，屬化縣第一區。

中華人民共和國成立后至1953年，沿襲南安、南岐2鄉設置，先后屬化縣東區、化縣一區。

1953年，改設石寧、霞山、旺嶺、長岐、南安、南嶺等鄉，屬化縣一區。

1958年9月，設南安鄉、東安鄉，屬同慶人民公社。

1961年9月，設南安人民公社、東安人民公社，屬同慶區。

1963年1月，撤區并社設立長岐人民公社，駐地長岐圩，轄12個生產大隊。

1983年10月，撤長岐人民公社改設長岐區，駐地長岐圩，轄12個鄉。

1987年2月，撤長岐區改設長岐鎮。