民國初期，沿襲清制，武威縣的行政管理區按水系劃分為六個渠，即黃渠（黃羊河水系）、大渠（雜木河上游）、雜渠（雜木河下游）、金渠（金塔河水系）、懷渠（西營河上游）、永渠（西營河下游）。

民國24年（1935），將六個行政管理區劃分為2個鎮、12個鄉，屬大河鄉。

中華人民共和國成立初屬大河區菖蒲鄉。

1952年屬清源區菖蒲鄉。

1958年人民公社化時期屬清源區清水公社，稱菖蒲溝大隊，后更名為曙光大隊。

1983年撤社設鄉時屬清水鄉，更名為菖蒲溝村民委員會。

2015年9月清水鄉撤鄉建鎮，屬清水鎮。