明代（1368-1644年）從1372-1644年設甘肅鎮陜西行都司、甘州府。

甘州府下設左、中、右、前、后五衛管轄甘州所屬區域。

五個墩隸屬中衛所轄。

清代（1644-1725）繼承明沿制。

仍設甘肅鎮、陜西行都司，甘州五衛。

甘州為鎮，行都司治所。

五個墩仍隸中衛所治。

清順治七年（1650年）撤銷甘州前衛、后衛。

民國25年（1936年）張掖縣屬甘肅省第六行政督察區，區置武威，五個墩村隸屬不變。

民國26年（1937年）五個墩村設聯保鄉公所1941年撤銷民國34年（1945年）屬張掖縣新豐鄉管轄1956年籌建張掖市（地級）、張掖同時存在。

1957年市建置撤銷張掖縣屬張掖專區，張掖縣設25個鄉，五個墩屬沙井鄉2002年10月撤銷張掖專區，成立張掖市2004年沙井鄉改為沙井鎮五個墩村屬沙井鎮管轄。