民國元年（1912年）后，屬和平鄉的一、二、五、六保。

1949年10月，建政后，屬和平區（后改二區）的新店、隆德、勝利、涇州4鄉。

1955年，撤區并鄉為第一鄉、第三鄉。

1958年9月，屬敦煌公社三危大隊。

1961年，成立五墩公社、三危公社。

1966年，更名曙光公社、先鋒公社。

1969年11月，復為五墩公社、三危公社。

1983年3月，改為五墩鄉、三危鄉。

2002年，五墩鄉改為莫高鎮。

2006年9月，三危鄉并入。