馬坪鄉境宋時屬安仁鄉沙澳里,明清時屬二十三都。

1923年屬外東區,1928年屬(第五)自治區，1937年屬(第三)區屬。

1940年屬馬坪鄉,1944年并鄉后屬前坪鄉。

1949年10月屬(第五)區。

1956年10月屬佛曇區。

1958年3月撤區后分屬馬坪鄉和林埭鄉。

1958年10月屬佛曇人民公社。

1961年7月屬文安公社。

1962年改稱馬坪公社。

1964年屬佛曇公社。

1987年8月從佛曇鎮分出設馬坪鄉。

1992年改為馬坪鎮并沿用至今。