始建于宋代,舊屬莆田縣,二十四鋪均屬水南境;宋、元時期屬感德鄉;明、清時期屬四區莆田里;民國社區屬三區洙亭保、登美保;新中國成立后為水南鄉,屬三區、五區、黃石區,后成立黃石鄉水南高級社;1958年后成立黃石人民公社水南生產大隊;“文化大革命”期間與澄沄大隊合并為紅巖大隊;1970年后又改為黃石人民公社水南生產大隊;1987年改稱水南村;2002年改為莆田市荔城區黃石鎮水南村,設水南村委會。
2014年設居委會。