南唐李暻中興元年（958），升永安場為建寧縣，始命名為水南，沿革至今。

民國時期設水南保。

中央蘇區時期其間，1931年6月成立水南鄉革命委員會，1932年11月經選舉產生“水南鄉蘇維埃政府”。

1950年2月11日成立水南村委員會，1951年2月成立水南鄉人民政府，1956年8月成立水南鄉人民委員會，1958年成立溪口人民公社水南大隊，1960年成立建寧綜合農場鄒家耕作管理委員會，不久更名為水南耕作區，1968年11月12日成立建寧縣綜合農場水南耕作區革命領導小組，1970年12月，改為城關公社水南大隊革命領導小組，1976年12月，綜合農場恢復建制，1977年1月成立綜合農場水南管理區，1981年，始改稱國營建寧縣綜合農場水南大隊管委會。

1991年5月19日成立建寧縣綜合農場水南村委員會，2007年10月屬濉溪鎮水南村村民委員會。