明代此地無集市，人們均往鄰近清溪縣（現內江市東興區石子鎮）趕集。

據傳曾有吳姓去清溪縣趕集，因與當地人鬧糾紛后，不讓吳再去趕集。

吳姓即在此修建幾間鋪店，故取名“吳家鋪"，后發展為集市。

古屬巴蜀之地。

明嘉靖四十五年（1566年），榮昌縣置4鎮27里，境域屬新橋里。

清乾隆至光緒時（1736年～1908年），榮昌縣劃分為4鄉12里，吳家鋪屬北鄉新橋里。

1919年，改吳家場為鎮團局。

1930年，改為吳家鎮公所，轄20個保。

1935年，榮昌縣設置3區、29鄉（鎮），吳家屬第二區，轄吳家、仁義、觀勝、河包、盤龍、保華、天寶、界石、復興、銅鼓。

1949年12月中旬，成立吳家區，改保為村。

1953年，吳家鎮將第十六、十七兩個村劃給高壩鄉；第十、十一、十二、3個村劃給永興鄉，第七、八、九、十三、十四、十五、十八、十九、二十共9個村劃給萬古鄉。

設立吳家鎮、高壩鄉、萬古鄉、永興鄉、吳家鄉，吳家鎮設3居民委員會。

1958年公社化時，永興鄉（現清流鎮）、玉方鄉和吳家鎮合并，成立吳家人民公社。

1962年，從吳家公社分出部份建立代興、永興、高壩公社。

1993年，榮昌縣撤區并鄉建鎮，吳家鄉、高壩鄉、代興鄉并入吳家鎮，下轄18村。

1996年，清流鎮榮江、玉芳、黃桷灘3村劃回吳家鎮。

2001年6月，十烈鄉整體12村并入吳家鎮，共沒33村4居民委員會。

2007年，將33村調整合并為雙流、高峰、含珠橋、玉峰、代興5村和燕子壩、人和、十烈3社區。