西周為燕國的都城所在地。

戰國為燕國中都屬地。

明代，為燕谷里。

清代，為琉璃河鎮。

民國五年（1916年），琉璃河鎮屬良鄉縣第六南一區。

民國十七年（1928年），琉璃河鎮屬良鄉縣三區。

1949年，琉璃河鎮屬良鄉縣七區。

1951年，琉璃河鎮屬良鄉縣三區。

1956年，琉璃河鎮屬良鄉縣。

1958年，琉璃河鎮屬周口店區琉璃河人民公社。

1960年，琉璃河鎮屬房山縣琉璃河人民公社。

1966年，設琉璃河鎮。

1968年，并入琉璃河人民公社。

1980年，恢復琉璃河鎮。

1983年，琉璃河公社改鄉。

1989年，琉璃河撤鄉設琉璃河地區辦事處。

2000年，在琉璃河地區辦事處設琉璃河鎮（兩塊牌子，一套人馬）。

2002年，合鄉并鎮，東南召鎮與窯上鄉并入琉璃河鎮。