1949年12月設苗庵鄉屬大店區。

1954年11月屬蒿溝區。

1955年12月重歸大店區。

1958年9月，劃歸草寺公社，苗庵為大隊。

1961年3月建苗庵公社。

1966年9月草寺公社并入苗庵公社。

1969年2月，原時村區所轄李圩公社和蒿溝公社東部地區劃歸苗庵公社。

1980年1月，設苗庵區，下設苗庵、李圩、王集、石橋、孫瓦房5個公社。

1984年5月，各公社更名為鄉。

1992年2月撤區并鄉，孫瓦房劃歸蒿溝鄉，苗庵、李圩、王集、石橋4個鄉合并為苗庵鄉。

2021年11月撤鄉設鎮改為苗庵鎮。