隋開皇十九年(599)，設霍邱縣，屬淮南郡。

唐初置蓼州，尋改壽州。

唐神功元年(697)，霍邱改為武昌縣。

景云元年(710)，復為霍邱縣，從此霍邱縣名基本穩定不變，但隸屬關系仍經常更迭。

五代十國屬壽州。

北宋屬淮南西路壽春府。

元代屬河南江北行中(尚)書省(又稱河南行省)安豐路總管府。

明代直隸南京鳳陽府壽州。

清初屬江南省(康熙年間成立安徽省)鳳潁六泗道(道員駐鳳陽府)。

1912年8月，屬安徽省第四區（駐阜陽）。

1932年6月，縣蘇維埃代表會決議改霍邱縣為紅城縣。

1949年，撤銷霍固縣，以原霍邱縣區域恢復霍邱縣。

1971年3月，六安專區改名六安地區，霍邱縣仍屬之。

2015年，設立六安市葉集區。

原霍邱縣的葉集鎮、三元鎮、孫崗鄉劃歸葉集區管轄。

2021年12月，撤銷霍邱縣臨淮崗鄉、馮瓴鄉，設立臨淮崗鎮、馮瓴鎮。