1934年設保，起垅村的大部分村民屬馬橋保；1950年改屬馬橋行政村；1952年4月改名起垅村，屬馬橋鄉；1956年4月跳頭、馬東等生產隊屬馬橋高級農業社；1958年10月，屬于大公圩公社馬橋大隊；1962年3月改名為起垅大隊，劃屬石橋人民公社；1969年3月，起垅、石橋兩公社合并為石橋人民公社起垅大隊，屬起垅公社管轄。

1984年體改，廢公社、大隊體制，成立鄉、行政村組織，原起垅大隊改為起垅行政村，屬石橋人民政府。

2005年10月，起垅村和新建村合并為起垅村村民委員會，屬石橋鎮人民政府。