解放前，曉星村屬合肥城南曉星鄉，解放后至1955年成立初級合作社，曉星村屬煙墩區曉星鄉。

1956年，成立曉星高級合作社，曉星村改為生產大隊。

1958年，成立合巢人民公社，曉星村屬曉星管理區。

1961年，曉星管理區劃分為大圩、曉星兩人民公社，曉星村屬曉星人民公社。

1968年，大圩、曉星兩公社合并成立東方紅人民公社，曉星村屬東方紅人民公社。

1972年，東方紅人民公社又分為大圩、曉星兩公社，曉星村屬于曉星人民公社。

1978年，合肥市區劃調整，大圩、曉星等公社一并劃為合肥市郊區。

1983年，社改鄉，成立曉星鄉曉星村民委員會。

1992年，大圩、曉星兩鄉合并成立大圩鄉，曉星村又屬大圩鄉管理。

2007年，鄉改鎮，曉星村屬于大圩鎮管理至今。